Sebelum mengendalikan pemekat, pengendali mesti membiasakan diri dengan struktur peralatan dan prosedur operasi, dan menjalankan pemeriksaan menyeluruh. Salur masuk suapan, alur keluar pelepasan dan pencuci limpahan mesti sentiasa bersih dan tidak terhalang; komponen kritikal-seperti aci kacau, garu, galas dan motor-mesti dalam susunan kerja yang betul. Sebelum dimulakan, sebarang bahan sisa dalam tangki mesti dibersihkan, dan sistem pelinciran dan mekanisme pengedap disahkan berfungsi dengan betul untuk mengelakkan kerosakan mekanikal atau kebocoran semasa pengaktifan. Operator dikehendaki memakai peralatan pelindung diri yang diperlukan untuk melindungi daripada kecederaan akibat kemalangan.
Semasa operasi pemekat, perhatian yang teliti mesti diberikan untuk mengawal kadar suapan dan paras cecair; ini menghalang bebanan bahan atau paras cecair yang berlebihan, yang boleh menyebabkan pengapungan buburan atau pencampuran tidak sekata. Sistem pengaut dan kacau mesti dikekalkan pada kelajuan putaran yang sesuai untuk mengelakkan pengaut daripada tersekat atau galas daripada menjadi lebih beban. Untuk bahan yang dicirikan oleh kepekatan tinggi, kelikatan tinggi atau kehadiran zarah halus, flokulan hendaklah digunakan dengan bijak-atau aliran bendalir dilaraskan-untuk meningkatkan kadar mendap dan meningkatkan kepekatan pepejal yang dinyahcas. Pada masa yang sama, pemeriksaan tetap perlu dilakukan untuk memantau getaran peralatan, paras hingar, dan turun naik arus motor; sebarang anomali mesti ditangani dengan segera untuk memastikan operasi peralatan yang selamat dan stabil.
Langkah berjaga-jaga keselamatan kekal sama kritikal semasa fasa penutupan dan penyelenggaraan. Sebelum ditutup, kadar suapan hendaklah dikurangkan dahulu; kuasa hendaklah diputuskan hanya selepas peralatan telah berhenti semula jadi, dan ia mesti disahkan bahawa garu dan pendesak telah menghentikan pergerakan sepenuhnya. Apabila membersihkan tangki, pendesak, dan garu, penjagaan mesti diambil untuk mengelakkan kesan mekanikal atau kerosakan; pada masa yang sama, galas, pengedap, dan sistem pelinciran hendaklah diperiksa untuk menentukan sama ada penyelenggaraan atau penggantian diperlukan. Dengan mematuhi prosedur pengendalian piawai dan melakukan penyelenggaraan tepat pada masanya, pengendali bukan sahaja dapat memanjangkan hayat perkhidmatan pemekat tetapi juga memastikan kecekapan pengasingan cecair pepejal-tekal, sambil meminimumkan kemalangan pengeluaran dan mengurangkan kos operasi pada masa yang sama.
